Peguei os meus todos usados e sempre fiz o que você falou: desmontei tudo, deixei no vanish por alguns dias, lavei com detergente depois tirando toda sujeira aparente.
Por dentro dos pescadores passei um barbante grosso com alguns nós para fazer contato com toda a parede e tirar a sujeira que...
Pra barra magnética não cair é só colocar um imã segurando ela por fora do erlenmeyer:)
Quanto as formigas, das vezes que fiz starter (foram poucas) nunca tive problemas, colocando papel alumínio para vedar, não lacrando...